Ученые Курчатовского института совместно со специалистами Санкт-Петербургского госуниверситета впервые определили кристаллическую структуру фермента RelSeq. Это он помогает нехорошим бактериям выживать, подтачивая наш организм. Благодаря RelSeq бактерии сохраняют устойчивость к антибиотикам.
Компьютерное моделирование показало, что структура RelSeq достаточно гибкая. Отдельные его части способны смещаться относительно друг друга. При этом молекула одного из «сигнальных веществ», pppGpp, может связываться сразу с несколькими участками фермента. Ученые определили предпочтительные участки такого связывания. Именно они могут стать мишенью для будущих лекарств. Если заблокировать взаимодействие RelSeq и pppGpp, бактерия станет гораздо уязвимее.
– Наши данные несомненно прольют свет на механизмы адаптации бактерий к стрессовым условиям. Это важно при разработке новых антибактериальных препаратов, – заявила руководитель проекта Дарья Виноградова. – В дальнейшем мы планируем получить кристаллические структуры RelSeq в комплексе с другими сигнальными молекулами, а также провести ряд экспериментов с использованием компьютерного моделирования, чтобы подобрать потенциальные лекарственные средства, воздействующие на активность фермента.
Фото: Из архива редакции
